超滤离心管通常不需要预处理即可使用，不过对于蛋白质样本处理，特别是较稀的蛋白质溶液来说(<10ug/mL),用超滤膜浓缩回收率常常是不定量的。虽然PES材料使非特异吸附Z小化，但是,某些蛋白,特别是稀的时候,会有问题。非特异结合的程度随着个别蛋白结构的不同而不同。含有带电的或者疏水结构域的蛋白质更易于不可逆结合到不同表面。对超滤离心管表面做钝化预处理可降低蛋白质在膜表面的吸附性损失，大多数情况下，在浓缩稀蛋白溶液之前预处理柱子可以提高回收率，因为溶液可填满膜和表面暴露的空白蛋白吸附位点。钝化的方法是预先用Z高容积的钝化溶液预浸泡柱子1小时以上，蒸馏水*冲洗柱子，再用蒸馏水离心一次以*除去可能残留在膜上的钝化溶液。注意钝化处理后别让膜干了。如果要留待以后使用，需要加无菌蒸馏水保持膜湿润。

　　超滤离心管通常不能消毒再次性使用。由于单管价格并不便宜，不少人尝试重复使用，经验是用蒸馏水清洗膜表面多次，离心一次到两次，那种可以反向离心的小管子可以加蒸馏水浸泡后反向多离心一次，会好些。可重复用于同一样品，不用时可用蒸馏水浸泡，但是要防止细菌污染。不同样品就不要混用了。有人说泡在20%酒精、1N的NaOH（氢氧化钠）中，防止长菌，而且防干，只要超滤膜侵了水，就不可以再让它干，但也有人说会破坏膜结构。反正厂家一般不支持重复用。多次重复使用会堵塞滤膜上的孔径，甚至出现漏液现象，影响实验结果。